Яков Никифорович Логвиненко во время империалистической войны был призван в царскую армию и направлен на фронт. В чине унтер-офицера после Октябрьского переворота Я. Логвиненко, возвратившись домой в Пишпек, участвовал во главе отряда солдат-фронтовиков в разгроме оренбургского атамана Дутова.
Я. И. Логвиненко - одного из активных борцов за Советскую власть в Семиречье и Киргизии. В сентябре 1918 г. командуя 1-м Пишпекским советским полком, он участвует в боях на Северном Семиреченском фронте, а в декабре этого же года в подавлении беловодского кулацко-эсеровского мятежа.
В 1919 г. Я. Н. Логвиненко назначается начальником гарнизона г. Пишпека, позднее - военкомом Семиреченского тракта, работает в Уполнаркомпроде.
Его полк участвовал в разгроме беловодского контрреволюционного эсеро-кулацкого мятежа. Логвиненко остался начальником гарнизона города Пишпека. После окончания сельскохозяйственного университета в Ташкенте Я. Н. Логвиненко возвратился в Киргизию на работу агрономом.
В 1933 г. после окончания Среднеазиатского государственного университета тяжело заболевает. Скончался 9 апреля 1933 года. Похоронили его в Дубовом парке в братской могиле с красногвардейцами.